Характеристика тканевого микроокружения является критическим элементом для понимания специфики молекулярных и клеточных механизмов патологичеких процессов и ответов на терапию. Система CODEX позволяет отображать более 40 белковых маркеров в образцах тканей в одной клетке. Высокая мультиплексная визуализация позволяет изучать различные клеточные фенотипы и их взаимодействие для понимания полной картины патологии и прогрессирования заболевания.
Антитела CODEX конъюгированы с запатентованными штрих-кодами - CODEX Barcodes. Штрих-код - уникальная олигонуклеотидная последовательность, комплементарная меченной флухрохромом репортерной олигонуклеотидной последовательности (CODEX Reporters). В процеccе эксперимента CODEX происходит связывание штрих-кодов (Barcodes) с помеченным красителем репортером (Reporters) для высокоспецифичного связывания.
Протокол эксперимента
1. Одноэтапное нанесение панели первичных антител,
конъюгированных с CODEX Barcodes, на срез ткани.
Визуализация маркеров происходит в несколько этапов.
2. Для каждого цикла визуализации три CODEX Reporters,
каждый со спектрально отличным флуорохромом,
наносятся на ткань с первичными антителами
для регистрации соответствующего штрих-кода антител.
Флуорохромы в каждом CODEX Reporters возбуждаются
источником света и регистрируется сигнал.
3. После регистрации сигнала в цикле происходит осторожная
промывка ткани для удаления CODEX Reporters специальными
реагентами без нагревания. Начинается следующий цикл.
4. Количество циклов будет зависеть от желаемого количества
маркеров. На одном срезе можно получить сигнал
от 50-ти маркеров.
Akoya’s CODEX Instrument.
Настольная система для автоматизации циклов визуализации с помощью CODEX Reporters. Совместима с инвертированным микроскопом Keyence BZ-X 700/800.
Keyence BZ-X 700/800
Инвертированный эпифлуоресцентный микроскоп — интегрированное решение для визуализации от Akoya является компактным решением, не требующим специального помещения.
Программное обеспечение CODEX® Instrument Manager (CIM).
Предназначено для управления инвертированным микроскопом Keyence BZ-X 700/800,
синхронизации каждого цикла анализа CODEX, получения последовательных изображений
флуоресцентно окрашенных образцов.
Специальные возможности CIM:
Отображение данных эксперимента, таких как маркеры, выбранные области, z-stack,
визуализация “популяций” маркеров с помощь теплово
Антитела конъюгированы с отдельными штрих-кодами CODEX. Каждый набор содержит одну пробирку с антителом CODEX и одну пробирку с соответствующим репортером, меченным красителем, достаточного объема для 25 тестов при стандартных условиях окрашивания. Рекомендуемые красители для ткани FFPE - Atto 550, Cy5 и Alexa Fluor TM 750.
Кат. номер /
Наименование
Антитела
Объем
Запрос
CD31-BX001 (EP3095)—Alexa Fluor™ 488-RX001
25 tests
CD31-BX001 (EP3095)—Alexa Fluor™ 750-RX001
25 tests
Histone H3 Phospho (Ser28)-BX030 (HTA28)—Cy5-RX030
25 tests
Keratin 14-BX002(Poly19053)—Atto 550-RX002
25 tests
Mac2/Galectin-3-BX035(M3/38)—Atto 550-RX035
25 tests
Pan-Cytokeratin-BX019 (AE-1/AE-3)—Alexa Fluor™ 488-RX019
25 tests
Pan-Cytokeratin-BX019 (AE-1/AE-3)—Alexa Fluor™ 750-RX019
25 tests
Кат. номер /
Наименование
Антитела
Объем
Запрос
CD138-BX010 (MI15)—Alexa Fluor™ 488-RX010
25 tests
CD138-BX010 (MI15)—Alexa Fluor™ 750-RX010
25 tests
Pan-Cytokeratin-BX019 (AE-1/AE-3)—Alexa Fluor™ 750-RX019
25 tests
Кат. номер /
Наименование
Антитела
Объем
Запрос
CD11b-BX025 (M1/70)—Alexa Fluor™ 488-RX025
25 tests
CD11b-BX025 (M1/70)—Alexa Fluor™ 750-RX025
25 tests
CD24-BX022 (M1/69)—Alexa Fluor™ 488-RX022
25 tests
CD24-BX022 (M1/69)—Alexa Fluor™ 750-RX022
25 tests
CD45-BX007 (30-F11)—Alexa Fluor™ 488-RX007
25 tests
CD45-BX007 (30-F11)—Alexa Fluor™ 750-RX007
25 tests
CD45R/B220-BX010 (Ra3-6B2)—Alexa Fluor™ 488-RX010
25 tests
CD45R/B220-BX010 (Ra3-6B2)—Alexa Fluor™ 750-RX010
25 tests
CD90.2-BX001 (30-H12)—Alexa Fluor™ 750-RX001
25 tests
CD90.2-BX001 (30-H12)—Alexa Fluor™ 488-RX001
25 tests
IgD-BX016 (11-26c.2a)—Alexa Fluor™ 488-RX016
25 tests
IgD-BX016 (11-26c.2a)—Alexa Fluor™ 750-RX016
25 tests
MHC II-BX014 (M5/114.15.2)—Atto 550-RX014
25 tests
Ter119-BX004 (TER-119)—Alexa Fluor™ 488-RX004
25 tests
Ter119-BX004 (TER-119)—Alexa Fluor™ 750-RX004
25 tests
CODEX Barcodes используются для конъюгации с пользовательскими первичными антителами для индивидуального дизайна панели антител. Каждый набор содержит одну пробирку с лиофилизированным штрих-кодом для использования в одной реакции конъюгации и две пробирки с репортерами. Для каждого штрих-кода имеется достаточный объем для конъюгации 50 мкг антител, что обеспечивает достаточно материала для 10–50 тестов в зависимости от концентрации и объема титра. В набор входит комплиментарный к баркоду репортер с флуорохромом.
Кат. номер /
Наименование
Barcodes
Размер
Запрос
Олигонуклеотиды, конъюгированные с флуорохромами, предназначенные для визуализации маркеров, путём взаимодействия с комплиментарным штрих-кодом с первичными антителами. Все CODEX Reporters пронумерованы для более удобного составления пары Barcodes- Reporters. Содержит достаточно материала для 10–50 тестов в зависимости от концентрации и объема титра.
Кат. номер /
Наименование
Barcodes
Размер
Запрос
Для полного проведения анализа CODEX требуются специально разработанные реагенты и буферы, начиная от реагента для окрашивания ядер до буфера для отмывки CODEX Reporters.
Кат. номер /
Наименование
Реагент
Объем
Запрос
Заявка
Кат. номер
Наименование
Объем
Удалить
Кол-во
Некорректно заполнены данные
Некорректно заполнены данные
Я даю свое согласие на обработку моих персональных данных и подтверждаю, что все указанные данные верны. ООО БиоЛайн гарантирует конфиденциальность получаемой информации в соответствии с Политикой конфиденциальности.
Ваше сообщение отправленно!
Ошибка! Ваше сообщение не отправленно!