Подготовка библиотек ДНК для NGS секвенирования
NGS-библиотека представляет собой набор фрагментов ДНК, подготовленных для проведения секвенирования. На первом этапе молекулы нуклеиновых кислот из исследуемого образца необходимо фрагментировать. Осуществляется этот процесс физическими или ферментативными способами. Далее проводится репарация концов фрагментов для последующего присоединения адаптеров, благодаря которым молекулы ДНК способны прикрепляться к платформе секвенирования. Также для мультиплексирования библиотек адаптеры могут содержать короткие последовательности – индексы (баркоды), которые позволяют отличать образцы друг от друга. После того, как библиотека подготовлена, она может быть амплифицирована, необходимо проверить ее качество. Для определения концентрации применяются такие методы, как спектрофлуориметрия, кПЦР, а для качественной оценки может быть использован гель-электрофорез. Реагенты Vazyme совместимы с платформами секвенирования Illumina, MGI и Ion Torrent.
Образец набора реагентов Vazyme для подготовки библиотек ДНК
1. Набор для подготовки библиотеки ДНК: VAHTS Universal DNA Library Prep Kit for Illumina V4 (ND610)
2. Набор адаптеров:
3. Магнитные частицы для очистки ДНК: VAHTS DNA Clean Beads (N411)
4. Определение концентрации ДНК: Equalbit dsDNA HS Assay Kit (EQ111/EQ121)
Наборы для подготовки ДНК библиотек
Наименование /
Наименование
Начальный объем матрицы ДНК
Платформа для секвенирования
Хранение
Количество
Номер по каталогу
Запрос
1 – 4 мкг
Illumina
При температуре -20 ⁰С (Box 1, 2 и 4);
При комнатной температуре (Box 3)
48 реакций
ND104-01
5 – 1000 нг
Ion Torrent
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
ND702-01
96 реакций
ND702-02
1 – 100 нг
Illumina и Ion Torrent
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NA201-01
96 реакций
NA201-02
1 – 100 нг
Illumina и Ion Torrent
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NA210-01
96 реакций
NA210-02
10 пг – 250 нг
Illumina
При температуре от 2 до 8 ⁰С (Box 1);
При температуре от -30 до -15 ⁰С (Box 2)
24 реакции
ND620-01
96 реакций
ND620-02
50 нг
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 / 96 реакций
TDM501-01/ TDM501-02
5 нг
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С;
При комнатной температуре (5 х TS terminate solution)
24 / 96 реакций
TDM502-01/ TDM502-02
1 нг
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С;
При комнатной температуре (5 х TS terminate solution)
24 / 96 реакций
TDM503-01/ TDM503-02
50 нг
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 / 96 реакций
TD501-01/ TD501-02
5 нг
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С;
При комнатной температуре (5 х TS terminate solution)
24 / 96 реакций
TD502-01/ TD502-02
1 нг
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С;
При комнатной температуре (5 х TS terminate solution)
24 / 96 реакций
TD503-01/ TD503-02
0,1 – 500 нг
MGI
При температуре от 2 до 8 ⁰С (Box 1);
При температуре от -30 до -15 ⁰С (Box 2)
24 реакции
TDM504-01
96 реакций
TDM504-02
0,1 – 500 нг
Illumina
При температуре от 2 до 8 ⁰С (Box 1);
При температуре от -30 до -15 ⁰С (Box 2)
24 реакции
TD504-01
96 реакций
TD504-02
100 пг – 1 мкг
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NDM617-01
96 реакций
NDM617-02
100 пг – 1 мкг
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
ND617-01
96 реакций
ND617-02
100 пг – 1 мкг
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С до 18 месяцев
24 реакции
NDM627-01
96 реакций
NDM627-02
100 пг – 1 мкг
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С до 18 месяцев
24 реакции
ND627-01
96 реакций
ND627-02
100 пг – 1 мкг
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NDM608-01
96 реакций
NDM608-02
100 пг – 1 мкг
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
ND608-01
96 реакций
ND608-02
100 пг – 4 мкг
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NDM607-01
96 реакций
NDM607-02
100 пг – 4 мкг
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции С / без ПЦР
ND607-01/ ND607-03
96 реакций С / без ПЦР
ND607-02/ ND607-04
100 пг – 1 мкг
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции С / без ПЦР
ND610-01/ ND610-03
96 реакций С / без ПЦР
ND610-02/ ND610-04
Наборы адаптеров и индексов для подготовки библиотек ДНК
Наименование /
Наименование
Состав набора
Платформа для секвенирования
Хранение
Количество
Номер по каталогу
Запрос
Наборы NA111-01/02: 12 различных адаптеров с индексами в каждом (10 мкл каждого)
Наборы NA111-03/04/05: 24 различных адаптеров с индексами в каждом (10 мкл каждого)
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С до 24 месяцев
12 х 10 реакций
NA111-01 / NA111-02
24 х 10 реакций
NA111-03 / NA111-04 / NA111-05
Наборы NA121-01/02: 12 различных адаптеров с индексами в каждом (10 мкл каждого)
Наборы NA121-03/04/05: 24 различных адаптеров с индексами в каждом (10 мкл каждого)
Ion Torrent
При температуре от -30 до -15 ⁰С до 24 месяцев
12 х 10 реакций
NA121-01 / NA121-02
24 х 10 реакций
NA121-03 / NA121-04 / NA121-05
В каждый набор входят: двойные адаптеры с UMI (480 мкл);
Уникальные UDB праймеры, 24 вида, различные в разных наборах (20 мкл каждый)
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С
96 реакций
NM35101 – NM35108
В каждом наборе: 24 различных адаптера с индексами
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С
20 мкл каждого
NM10901 / NM10902 / NM10903 / NM10904
Set 8: 96 видов адаптеров с индексами
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С до 12 месяцев
10 мкл каждый
NM108-01
40 мкл каждый
NM108-02
В наборе 8 видов N5XX индексов и 12 видов N7XX индексов, обеспечивающих 96 видов двойных адаптеров с индексами
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
192 реакции
TD202
В наборе 16 видов N6XX индексов и 24 вида N8XX индексов, обеспечивающих 384 видов двойных адаптеров с индексами
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
768 реакций
TD203
В каждом наборе: универсальный N101 (i5) и 96 N9XX (i7) индексов, обеспечивающих 96 видов адаптеров с индексами одного конца;
TD204: N101 коннектор Р5-конца и 24 коннектора Р7-конца (N901 – N924);
TD205: N101 коннектор Р5-конца и 24 коннектора Р7-конца (N925 – N948);
TD206: N101 коннектор Р5-конца и 24 коннектора Р7-конца (N949 – N972);
TD207: N101 коннектор Р5-конца и 24 коннектора Р7-конца (N973 – N996)
Illumina
При температуре -20 ⁰С до 18 месяцев
192 реакции
TD204 / TD205 / TD206 / TD207
В каждый набор входят: двойные Y-адаптеры с UMI (480 мкл);
По 24 уникальных UDI праймера, различных для наборов (20 мкл каждый)
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С до 18 месяцев
96 реакций
N351 / N352 / N353 / N354
В наборах VAHTS Adapter-S; 8 VAHTS i5 и 12 VAHTS i7 праймеров ПЦР
Illumina
При температуре -20 ⁰С до 18 месяцев
192 реакции
N321-01 / N322-01
Каждый набор содержит по 24 вида адаптеров с индексами (20 мкл каждого)
Set 3: адаптеры 96-01 – 96-24;
Set 4: адаптеры 96-25 – 96-48;
Set 5: адаптеры 96-49 – 96-72;
Set 6: адаптеры 96-73 – 96-96
Illumina
При температуре -20 ⁰С до 12 месяцев
N805 / N806 / N807 / N808
Set 1: 12 видов адаптеров с индексами (DNA Adapter 1 – 12), 10 или 40 мкл каждого;
Set 2: 12 видов адаптеров с индексами (DNA Adapter 13 – 27), 10 или 40 мкл каждого
Illumina
При температуре -20 ⁰С до 12 месяцев
24 реакции
N801-01 / N802-01
96 реакций
N801-02 / N802-02
В набор входят 24 вида NTMXXX индексов (40 мкл каждый);
Универсальный праймер (960 мкл)
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С
192 реакции
TDM101-01 / TDM102-01 / TDM103-01 / TDM104-01
Содержит 384 уникальных UDI адаптера (20 мкл каждый)
Set 1: UDIA 001 - UDIA 096
Set 2: UDIA 097 - UDIA 192
Set 3: UDIA 193 - UDIA 288
Set 4: UDIA 289 - UDIA 384
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
384 реакции
N34201 / N34202 / N34203 / N34204
В каждом наборе: 8 видов NTM5XX и 12 видов NTM7XX индексов, обеспечивающих 96 видов адаптеров с двойными индексами
MGI
30 до -15 ⁰С
192 реакции
TDM201-01
Дополнительные реагенты для подготовки библиотек ДНК
Наименование /
Наименование
Хранение
Количество
Номер по каталогу
Запрос
При температуре от -30 до -15 ⁰С до 24 месяцев
2000 Ед
N101-01
При температуре от -30 до -15 ⁰С до 24 месяцев
10000 Ед
N102-01
При температуре -20 ⁰С до 24 месяцев
600000 Ед
N103-01
При температуре от -30 до -15 ⁰С до 24 месяцев
5000 Ед
N104-01
При температуре -20 ⁰С до 24 месяцев
5000 Ед
N105-01
При температуре -20 ⁰С
250 Ед
N106-01
125 Ед
N106-02
При температуре -20 ⁰С
250 Ед
N106-01
125 Ед
N106-02
При температуре от -30 до -15 ⁰С
16 реакций
NM201-01
48 реакций
NM201-02
При температуре от -20 ⁰С
96 реакций
NA205-02
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NA215-01
96 реакций
NA215-02
При температуре от -30 до -15 ⁰С
96 реакций
TD601-01
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
N616-01
96 реакций
N616-02
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NM618-01
96 реакций
NM618-02
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
N618-01
96 реакций
N618-02
При температуре от -20 ⁰С
24 реакции
N204-01
96 реакций
N204-02
При температуре от -30 до -15 ⁰С до 18 месяцев
24 реакции
N203-01
96 реакций
N203-02
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NA301-01
96 реакций
NA301-02
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NA312-01
96 реакций
NA312-02
При температуре от 2 до 8 ⁰С
5 мл
N411-01
60 мл
N411-02
450 мл
N411-03
При температуре от 2 до 8 ⁰С, в защищенном от света месте
100 реакций
EQ111-01
500 реакций
EQ111-02
При температуре от 2 до 8 ⁰С, в защищенном от света месте
100 реакций
EQ121-01
500 реакций
EQ121-02
Подготовка библиотек РНК для NGS секвенирования
Для создания РНК NGS-библиотеки первоначально необходимо синтезировать последовательность кДНК. Фрагментацию НК исследуемого образца можно производить перед обратной транскрипцией или после. Затем происходит лигирование адаптеров, после чего можно отобрать определенный тип РНК для последующего анализа. Например, для обогащения библиотеки мРНК возможны два варианта: либо деплеция рРНК, либо захват РНК с полиаденилированными концами при помощи олигопраймеров. Анализ транскриптома позволяет исследовать посттранскрипционные модификации, определять мутации и изменения в уровнях экспрессии генов. Реагенты Vazyme совместимы с платформами секвенирования Illumina, MGI и Ion Torrent.
Образец набора реагентов Vazyme для подготовки библиотек РНК
1. Набор для подготовки библиотеки РНК VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina (NR605)
2. Набор адаптеров:
3. Магнитные частицы для очистки РНК: VAHTS RNA Clean Beads (N412)
4. Наборы для обогащения мРНК и деплеции рРНК:
5. Определение концентрации РНК: Equalbit RNA Assay Kit (EQ211/EQ212)
Наборы для подготовки РНК библиотек
Наименование /
Наименование
Исходное количество матрицы РНК
Платформа для секвенирования
Хранение
Количество
Номер по каталогу
Запрос
16 – 38 Ct (вирусная РНК)
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NA211-01
96 реакций
NA211-02
100 нг – 1 мкг
Illumina
При температуре от -85 до -65 ⁰С (адаптер RL5);
При комнатной температуре (колонка для фильтрации);
При температуре от -30 до -15 ⁰С (остальное)
24 реакции
NR801-01
96 реакций
NR801-02
0,05 – 4 мкг
Illumina
При температуре от 2 до 8 ⁰С (Box 1);
При температуре от -30 до -15 ⁰С (Box 2)
24 реакции
NR612-01
96 реакций
NR612-02
0,05 – 5 мкг
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NRM604-01
96 реакций
NRM604-01
0,05 – 5 мкг
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NR604-01
96 реакций
NR604-02
10 нг – 5 мкг
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NRM605-01
96 реакций
NRM605-02
Наборы адаптеров и индексов для подготовки библиотек РНК
Наименование /
Наименование
Состав набора
Платформа для секвенирования
Хранение
Количество
Номер по каталогу
Запрос
96 различных адаптеров с индексами
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С
10 мкл (каждого)
NM208-01
40 мкл (каждого)
NM208-02
1 универсальный праймер (120 мкл);
48 праймеров к индексам мироРНК (10 мкл каждого)
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
48 реакций
N813
48 реакций
N814
48 реакций
N815
48 реакций
N816
VAHTS адаптер RNA Adapter-S;
8 VAHTS i5 ПЦР праймеров (RM501-RM508);
12 VAHTS i7 ПЦР праймеров (RM701-RM712)
Illumina
При температуре -20 ⁰С
192 реакции
N323-01
192 реакции
N324-01
Set 3: 24 различных адаптеров с индексами (96-01 – 96-24), 20 мкл каждого
Set 4: 24 различных адаптеров с индексами (96-25 – 96-48), 20 мкл каждого
Set 5: 24 различных адаптеров с индексами (96-49 – 96-72), 20 мкл каждого
Set 6: 24 различных адаптеров с индексами (96-73 – 96-96), 20 мкл каждого
Illumina
При температуре -20 ⁰С один год
192 реакции
N809
192 реакции
N810
192 реакции
N811
192 реакции
N812
Set 1: 1 – 12 адаптеров с индексами, 10 мкл / 40 мкл каждого
Set 2: 13 – 27 адаптеров с индексами, 10 мкл / 40 мкл каждого
Illumina
При температуре -20 ⁰С один год
48 реакций
N803-01 / N804-01
192 реакции
N803-02 / N804-02
Дополнительные реагенты для подготовки библиотек РНК
Наименование /
Наименование
Исходное количество матрицы РНК
Хранение
Количество
Номер по каталогу
Запрос
0,01 – 12,5 мкг
При температуре 4 ⁰С
24 реакции
N401-01
96 реакций
N401-02
0,01 – 12,5 мкг
При температуре от 2 до 8 ⁰С
24 реакции
N403-01
96 реакций
N403-02
-
При температуре -20 ⁰С
936 мкл
N402-01
0,1 – 1 мкг
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
N406-01
96 реакций
N406-02
0,01 – 1 мкг
При температуре от -30 до -15 ⁰С
12 реакций
N407-01
24 реакции
N407-02
1 – 5 мкг
При температуре от -30 до -15 ⁰С
12 реакций
N409-01
24 реакции
N409-02
0,01 – 1 мкг
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
N408-01
96 реакций
N408-02
0,01 – 1 мкг
При температуре от -30 до -15 ⁰С
12 реакций
N417-01
24 реакции
N417-02
0,01 – 1 мкг
При температуре от -30 до -15 ⁰С (Box 1);
При температуре от 2 до 8 ⁰С (Box 2)
12 реакций
N420-01
24 реакции
N420-02
-
При температуре от 2 до 8 ⁰С
5 мл
N412-01
40 мл
N412-02
450 мл
N412-03
2 – 1000 нг
При температуре от 2 до 8 ⁰С, в защищенном от света месте
100 реакций
EQ212-01
500 реакций
EQ212-02
25 пг – 100 нг
При температуре от 2 до 8 ⁰С, в защищенном от света месте
100 реакций
EQ211-01
500 реакций
EQ211-02
Подготовка библиотек ДНК и РНК совместно для NGS секвенирования
Наборы для совместной подготовки библиотек ДНК и РНК содержат реагенты для обратной транскрипции, синтеза двуцепочечной кДНК, фрагментации, восстановления концов фрагментов, лигирования адаптеров и амплификации библиотеки. Возможность создания библиотек секвенирования из смешанных образцов, наборы подходят для обнаружения патогенных микроорганизмов.
Подготовка библиотек ДНК и РНК совместно для NGS секвенирования
Наименование /
Наименование
Начальный объем матрицы
Платформа для секвенирования
Хранение
Количество
Номер по каталогу
Запрос
10 – 100 нг РНК
1 – 100 нг ДНК
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NC601-01
96 реакций
NC601-02
10 – 100 нг РНК
1 – 100 нг ДНК
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NCM601-01
96 реакций
NCM601-02
Реагенты для экзомного секвенирования
В то время, как полногеномное секвенирование предполагает прочтение всей последовательности ДНК организма, секвенирование экзома служит для исследований только кодирующих белок участков. Экзом составляет лишь 1 – 2 % от всего генома, но большая часть мутаций, ассоциированных с генетическими заболеваниями, приходится именно на кодирующие белок гены. Для подготовки NGS-библиотек необходимо произвести обогащение экзомных участков ДНК.
Реагенты для экзомного секвенирования
Наименование /
Наименование
Платформа секвенирования
Хранение
Количество
Номер по каталогу
Запрос
-
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NC001-01
96 реакций
NC001-02
-
При температуре от -30 до -15 ⁰С (Box 1);
При температуре от 2 до 8 ⁰С (Box 2)
24 реакции
NC103-01
96 реакций
NC103-02
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NC101-01
96 реакций
NC101-02
MGI
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
NCM101-01
96 реакций
NCM101-02
Реагенты для эпигенетических исследований
Исследование метилирования последовательностей ДНК происходит при помощи бисульфитного секвенирования. Для подготовки библиотек в данном случае необходимо провести бисульфитную конверсию – процесс, при котором неметилированный цитозин превращается в урацил, а в ходе ПЦР амплифицируется как тимин, в то время как метилированный цитозин остается неизменным. Данный подход используется для изучения генетических мутаций.
Наборы для подготовки библиотек метилированной ДНК
Наименование /
Наименование
Начальный объем матрицы ДНК
Совместимый тип образцов
Хранение
Количество
Номер по каталогу
Запрос
10 пг – 250 нг
Геномная ДНК; ДНК из FFPE образцов; внеклеточная ДНК; микробная ДНК
При температуре от 2 до 8 ⁰С (Box 1);
При температуре от -30 до -15 ⁰С (Box 2) до 12 месяцев
24 реакции
NE103-01
96 реакций
NE103-02
100 пг – 2 мкг
Внеклеточная ДНК; очищенные ПЦР продукты; ДНК из клеток тканей животных, растений, микроорганизмов
При комнатной температуре;
Смесь хранить при комнатной температуре 24 часа или при температуре от -30 до -15 ⁰С в течение 1 месяца, в защищенном от света месте
50 реакций
EM101-01
200 реакций
EM101-02
100 пг – 2 мкг
Внеклеточная ДНК; ДНК из клеток тканей животных, растений, микроорганизмов
При комнатной температуре;
Смесь хранить при комнатной температуре 24 часа или при температуре от -30 до -15 ⁰С в течение 1 месяца, в защищенном от света месте
50 реакций
EM103-01
200 реакций
EM103-02
0,5 – 200 нг
гДНК, кДНК, плазмидная ДНК
При температуре от -30 до -15 ⁰С
1 мл
EM201-01
5 х 1 мл
EM201-02
15 х 1 мл
EM201-03
0,5 – 200 нг
гДНК, кДНК, плазмидная ДНК
При температуре от -30 до -15 ⁰С
1 мл
EM202-01
5 х 1 мл
EM202-02
15 х 1 мл
EM202-03
-
-
При температуре -20 ⁰С в течение одного года
100 Ед
P507-01
500 Ед
P507-02
Наборы для амплификации геномов и транскриптомов единичных клеток
Исследования единичных клеток при помощи секвенирования требует выделения отдельных клеток, экстракции их НК, подготовки библиотеки и непосредственно процесса прочтения последовательности и ее анализа. Для создания библиотеки секвенирования нуклеотидную последовательности одной клетки необходимо амплифицировать для обеспечения возможности проведения анализа. Наборы для синтеза кДНК и амплификации совместимы с образцами с низкой исходной концентрацией НК.
Наборы для амплификации геномов и транскриптомов единичных клеток
Наименование /
Наименование
Исходный объем образца
Хранение
Количество
Номер по каталогу
Запрос
1 – 1000 клеток или 10 пг – 10 нг тотальной РНК
При температуре -70 ⁰С (Box 1);
При температуре -20 ⁰С (Box 2)
12 реакций
N711-01
24 реакции
N711-02
96 реакций
N711-03
1 – 500 клеток или 10 пг – 10 нг тотальной РНК
При температуре от -85 до -65 ⁰С (Box 1);
При температуре от -30 до -15 ⁰С (Box 2)
12 реакций
N712-01
24 реакции
N712-02
96 реакций
N712-03
1 – 1000 клеток или 1 – 10 нг ДНК
При температуре от -30 до -15 ⁰С, при температуре от -85 до -65 ⁰С до 12 месяцев
24 реакции
N603-01
96 реакций
N603-02
Реагенты для CUT&RUN и CUT&TAG секвенирования
Технологии CUT&RUN и CUT&TAG предназначены для исследований взаимодействий ДНК и белков. CUT & RUN-секвенирование (или расщепление под мишенями и высвобождение с помощью нуклеазы) позволяет идентифицировать сайты связывания ДНК-ассоциированных белков за счёт расщепления фрагментов ДНК вблизи данных участков. Нацеленная фрагментация контролируется антителами и осуществляется с помощью микрококковой нуклеазы (MNase), слитой с белком А/G. CUT&TAG-секвенирование (или расщепление под мишенями и тегирование), по сравнению с CUT&RUN, является более усовершенствованным, так как не требует лизирования клеток и фракционирования хроматина. Технология CUT&TAG основана на образовании комплекса белка А или G и высокоактивной траспозазы Tn5, который, благодаря антителам, точно связывается с ДНК последовательностью вблизи белка-мишени и производит ее мечение.
Методы применимы для картирования сайтов связывания ДНК с белками интереса, анализа факторов транскрипции, регуляции экспрессии генов. Взаимодействия белков с ДНК отвечают за регуляцию экспрессии генов и многие биологические процессы, которые могу приводить к различным заболеваниям.
Реагенты для CUT&RUN и CUT&TAG секвенирования
Наименование /
Наименование
Исходное количество образца
Платформа для секвенирования
Хранение
Количество
Номер по каталогу
Запрос
5000 – 500 000 клеток
Illumina
При температуре от 2 до 8 ⁰С (Box 1);
При комнатной температуре (Box 2);
При температуре от -30 до -15 ⁰С (Box 3)
24 реакции
HD102-01
5000 – 500 000 клеток
-
При температуре от 2 до 8 ⁰С (Box 1);
При комнатной температуре (Box 2);
При температуре от -30 до -15 ⁰С (Box 3)
24 реакции
HD101-01
48 реакций
HD101-02
-
-
При температуре от 2 до 8 ⁰С
250 мкл
N515-01
1 мл
N515-02
5 мл
N515-03
-
Illumina
При температуре от -30 до -15 ⁰С
48 реакций
NS101-01
-
-
При температуре от -30 до -15 ⁰С
24 реакции
TD612-01
96 реакций
TD612-02
10 – 100 000 клеток
Illumina
При температуре от 2 до 8 ⁰С (Box 1);
При температуре от -30 до -15 ⁰С (Box 2)
12 реакций
TD904-01
48 реакций
TD904-02
60 – 100 000 клеток
Illumina
При температуре от 2 до 8 ⁰С (Box 1);
При температуре от -30 до -15 ⁰С (Box 2)
12 реакций
TD903-01
48 реакций
TD903-02
60 – 100 000 клеток
Illumina
При температуре от 2 до 8 ⁰С (Box 1);
При температуре от -30 до -15 ⁰С (Box 2)
12 реакций
TD901-01
48 реакций
TD901-02
От 60 клеток
Illumina
При температуре от -85 до -65 ⁰С
10 мкг
S603-01
20 мкг
S603-02
От 60 клеток
Illumina
При температуре от -85 до -65 ⁰С
10 мкг
S602-01
20 мкг
S602-02
От 50 клеток
-
При температуре от -30 до -15 ⁰С
200 Ед
S702-01
От 50 клеток
-
При температуре от -30 до -15 ⁰С
200 Ед
S701-01
Дополнительные реагенты и расходные материалы
Очистка НК магнитными частицами
Наименование /
Наименование
Хранение
Количество
Номер по каталогу
Запрос
При температуре от 2 до 8 ⁰С
5 мл
N411-01
60 мл
N411-02
450 мл
N411-03
При температуре от 2 до 8 ⁰С
5 мл
N412-01
40 мл
N412-02
450 мл
N412-03
При температуре от 2 до 8 ⁰С
2,5 мл
N512-01
10 мл
N512-02
При температуре 15 – 25 ⁰С
0,2 мл (объем пробирок)
СМ101
1,5 мл (объем пробирок)
СМ103
Наборы для определения концентрации нуклеиновых кислот (Qubit)
Наименование /
Наименование
Диапазон объемов образца
Хранение
Количество
Номер по каталогу
Запрос
2 – 1000 нг
При температуре от 2 до 8 ⁰С, в защищенном от света месте
100 реакций
EQ212-01
500 реакций
EQ212-02
250 пг – 100 нг
При температуре от 2 до 8 ⁰С, в защищенном от света месте
100 реакций
EQ211-01
500 реакций
EQ211-02
10 пг – 100 нг
При температуре от 2 до 8 ⁰С, в защищенном от света месте
100 реакций
EQ111-01
500 реакций
EQ111-02
0,2 – 100 нг
При температуре от 2 до 8 ⁰С, в защищенном от света месте
100 реакций
EQ121-01
500 реакций
EQ121-02
Набор для количественной оценки библиотек секвенирования для платформы Illumina
Наименование /
Наименование
Хранение
Номер по каталогу
Запрос
При температуре от -30 до -15 ⁰С, в защищенном от света месте
NQ101
При температуре от -30 до -15 ⁰С, в защищенном от света месте
NQ102
При температуре от -30 до -15 ⁰С, в защищенном от света месте
NQ103
При температуре от -30 до -15 ⁰С, в защищенном от света месте
NQ104
При температуре от -30 до -15 ⁰С
NQ105
При температуре от -30 до -15 ⁰С
NQ106